我国科研评价体系伴随科研水平的不断提高已渐趋合理，但与国际学术界通行方式相比仍存在不少问题，尤其行政主导、过度量化和以刊评文等弊端制约我国原创能力和科研影响力提高。
一个重要原因是学术共同体未能充分、恰当、有效发挥作用，导致至少三方面后果：一是在进行学术评价时，凡不可量化因素，难以在评价中获得应有肯定，导致评价对论文的过度倚重；二是评价主体不得不采用各种额外措施保障评价“公正性”，比如对论文进行计算机查重、对成果进行盲审，甚至是双盲评审等，从而增加评价成本；三是在科研项目、人才计划、科研奖评审中，不得不依靠相对超脱的大同行专家进行把关，由于无法专业判断，致使论文、篇数、刊物级别等被过分强调。
为更好支撑科技创新，需要着力改革现有科研评价体系。而改革科研评价体系，需要从最基础性环节，即学术共同体建设入手。对此，建议：
一、明确划分行政管理部门和专家学者在科研评价中的分工和定位，界定行政管理人员是学术评价的组织者，管理部门不应直接介入评审过程，应将学术评价权力和责任主体归于学者和学术共同体。
二、政府主管部门、各学术单位在建立健全评价专家信誉制度、问责制度和信息公开制度基础上，在科研评价活动中放手发挥学术共同体作用。通过鼓励和监督相结合方式，推动学术共同体承担起科研评价主体职责。
三、加强科研文化建设，鼓励学术批评，推动学术共同体提高责任意识和自律意识，逐步形成良好科研评价文化和传统，并在此基础上建立更加客观、公正、科学的学术评价体系，推动我国科技创新能力，特别是原始创新能力的进一步提高。
